農業灌溉滴灌設備的管道系統難免會流通大大小小的沉淀物，以及一些肥料農藥殘留，沖洗是必要的。如果水源水質較差，細小雜質較多，那么毛管要經常沖洗，每周一次拆掉PE毛管的末端滴灌滴頭，沖洗掉末端積垢處的細小顆粒，滴頭進行泡水沖洗。沖洗過程中管道要依次打開，不要同時全開，以維持管道內的壓力。農人乙灌溉強調，每個灌溉單元需要每月進行一次沖洗，打開灌溉單元的主管或干管末端堵頭，提高水壓進行沖洗。沖洗結束后，要記得清空水流，封堵管道。